要彻底清除浏览器网站历史记录，保护隐私不留痕迹，可以采取以下几种方法：
1. 使用无痕浏览模式：大多数现代浏览器都支持无痕浏览模式。当你启动这个模式时，浏览器会创建一个临时的窗口，不保存任何浏览数据，包括历史记录、cookies和缓存等。关闭无痕浏览窗口后，这些数据就会被自动删除。
2. 清除浏览器缓存和cookies：在无痕浏览模式下，你还可以清除浏览器的缓存和cookies。这有助于确保没有网页内容被存储在本地计算机上。
3. 使用第三方清理工具：有些第三方软件可以帮助你彻底清除浏览器历史记录和其他数据。这些工具通常提供更全面的清理选项，但请确保从可信的来源下载，以避免恶意软件的风险。
4. 手动删除浏览器数据：如果你使用的是旧版浏览器或需要手动管理数据，可以尝试手动删除浏览器数据。这通常涉及访问浏览器的设置菜单，找到与数据管理相关的选项，然后选择删除所有数据。
5. 使用加密技术：一些浏览器提供了加密功能，可以在不显示历史记录的情况下查看网页内容。这种方法可以在一定程度上保护隐私，但可能不如无痕浏览模式彻底。
6. 定期清理浏览器数据：除了手动删除数据外，还可以定期清理浏览器数据，以减少历史记录的积累。这可以通过浏览器的“清除浏览数据”或“清除历史记录”功能来实现。
7. 使用隐私插件：有些浏览器插件可以帮助你更好地控制隐私设置，例如阻止跟踪、限制广告等。这些插件通常提供额外的隐私保护功能。
总之，彻底清除浏览器网站历史记录需要谨慎操作，以确保不会意外地留下任何痕迹。在使用无痕浏览模式时，务必小心谨慎，以免不小心打开其他不需要的网站或下载恶意软件。